Hjärnegatan är uppkallad efter läkaren och naturforskaren Urban Hjärne (1641-1724), känd bland annat som den som fick de beryktade häxprocesserna i Stockholm på 1600-talet att upphöra. Hjärne hade en medicinalväxtträdgård och kemiskt labaratorium på det som senare blev Serafimerlasarettets område. Hjärne var initiativtagare till brunnsverksamheten vid Medevi brunn, norr om Motala och var gift tre gånger och efterlämnade 25 barn. Hjärnegatan låg tidigare utmed Kronobergsparken där Parkgatan nu ligger.